实际上，宝石的鉴定是一项相对复杂的工作，单纯的使用肉眼并不能够鉴定出宝石，这需要一定的经验并且辅助相应的仪器才可以完成。那么对于珠宝鉴定是来讲，在鉴定的时候需要使用以下一些经验与手段：
一、原石的鉴别由于晶体具有自限性，在生长的过程中可以自发的形成规则的几何多面体的形态，因此很多单晶类宝石原石往往具有非常规则的形态，例如钻石可以形成八面体、萤石可以形成四面体、祖母绿（或者绿柱石）可以形成六方柱状，另外，有些宝石的晶面往往存在一些特殊的纹理，例如碧玺的晶面具有纵纹，水晶的晶面具有横纹，因此，根据相关宝石的形态特征，就可以判断出宝石的种属。下图为祖母绿的原石晶体。
二、成品宝石的鉴别：
1、肉眼观察对于成品宝石来讲，需要通过肉眼观察、仪器测得两个步骤，其中肉眼观察包裹的内容有宝石的颜色、光泽、火彩、透明度等等，肉眼的观察的结果会会使得珠宝鉴定师心中有一个预判，例如宝石的颜色虽然是丰富多彩的，但是相关的颜色也会存在的一定的差异，例如红宝石与红碧玺之间的“红色”明显的不同，其中红宝石的颜色多为正红色、粉红色等等，而碧玺的红色看起来则相对较暗，并且可能带有褐色的色调。宝石的光泽通常与宝石的抛光程度与折射率密切相关，在抛光良好的前提下，光泽与折射率值呈正比，折射率越高，宝石的光泽越强，因此通过光泽的观察，可大致对比出宝石折射率的差异。例如钻石的折射率明显要高于一些仿钻，例如立方氧化锆，有些仿钻的折射率高于钻石，例如合成碳化硅（莫桑钻），因此通过光泽上的感受，可以初步的感受两者之间的差异。宝石的火彩与宝石的色散值密切相关，不同宝石的色散值不同，从而导致火彩上有一定的差异，例如合成碳硅石（莫桑钻）的色散值（0.104）大约是钻石色散值（0.44）的2.5倍，因此合成碳化硅具有非常漂亮的火彩。因此通过火彩的判断，可以大致判断出宝石的种属。

2、仪器鉴定在肉眼观察的基础上，心中会有几个选项作为备选，并通过珠宝鉴定仪器来进行验证，常规的仪器包括折射仪、显微镜、偏光镜、分光镜、二色镜等，其中折射仪与显微镜是宝石鉴定中非常重要的两个仪器，每个宝石都有特定的折射率、双折射率、光性与轴性，因此在精准的测定宝石折射率的前提之下，就可以很好的确定宝石的种属，而显微镜重要的用途是通过放大观察鉴定宝石是否为天然、或者是否经过优化处理。其他仪器则以辅助的形式再次进行验证，例如，对于具有特征光谱的宝石，可利用分光镜进行验证。
偏光镜可以快速的确定宝石的光性特征；二色镜可以观察宝石的多色性特征等。但是常规仪器在鉴定宝石的过程中存在一定的局限性，例如，常规仪器无法鉴定天然与合成钻石，此时就需要借助大型仪器来进行判断，宝石鉴定中常用到的大型仪器则包括光谱仪、阴极发光仪、激光拉曼光谱、电子探针、LA-ICP-MS等，他们或通过宝石光谱的测定，或通过成像的方式解析结构，或通过成分的分析来精准的鉴定宝石，是常规仪器重要的补充手段。下图为美国宝石学院（GIA）的LA-ICP-MS，主要用于测定宝石的微量元素组成，该项测试属于一种微损测试。这些大型仪器不仅体型较大，部分仪器往往需要独立的空间作为实验室，而且价格昂贵，并且后期的维护成本相对较高，因此测试的费用也相对较大，但是它能够更为精准的测定宝石的各项参数，解决常规仪器无法解决的问题。